Das war ein richtiger guter Hinweis! Ich hatte Glück und ein noch einen ca. 2 Monate alten MariaDB Ordner gefunden. Den habe ich dann in appdata ersetzt und jetzt funktioniert wieder alles einwandfrei. Habe dann in der Nextcloud Console noch den Befehl "sudo -u abc php /config/www/nextcloud/console.php files:scan --all" eingefügt und jetzt ist die Datenbank hoffentlich auf den neuesten Stand.
